广州医科大学在呼吸疾病、恶性肿瘤、免疫调节剂、化学致癌研究、蛇毒、腔内镜、试管婴儿、优生优育和神经病学、人文社会科学、医学伦理学方面的研究取得了丰硕的成果。学校有22个研究所/中心，1个国家临床医学研究中心，有包括国家重点实验室在内的29个市级以上重点实验室，其中1个国家重点实验室、1个省部共建重点实验室、6个广东省重点实验室，4个广东省教育厅重点实验室、4个广东省卫生厅医学重点实验室、10个广州市重点实验室和1个广州市人文社科重点研究基地。
学校设有研究生学院、国际教育学院、继续教育学院、基础学院、药学院、口腔医学院、卫生管理学院、公共卫生学院、护理学院、金域检验学院、卫生职业技术学院、第一临床学院、第二临床学院、第三临床学院等15个二级学院，以及广东省全科医学培训中心。
开设临床医学、医学检验、医学影像学、护理学、麻醉学、口腔医学、预防医学、药学、康复治疗学、公共事业管理、生物医学工程、应用心理学、生物技术、中西医临床、法学、统计学、信息管理与信息系统、市场营销、生物科学、食品质量与安全等20个本科专业。其中，临床医学专业、医学影像学、医学检验技术、康复治疗学、麻醉学、药学6个专业为普通高等教育本科第一批次招生专业，并招收外国留学生。成人高等医学教育本、专科设有8个专业。
其中临床医学、医学检验是国家特色建设专业，临床医学、医学检验、医学影像学、护理学是广东省高等学校本科特色专业，临床医学、医学检验、医学影像学是广东省名牌专业，临床医学、医学检验、医学影像学和护理学是广州市名牌专业。基础医学实验中心、全科医学实验教学中心是广东省高校实验教学示范中心。内科学（呼吸系病）是国家级重点学科，中西医结合临床是国家中医药管理局重点学科，临床医学一级学科是广东省攀峰重点学科，全科医学二级学科是广东省优势重点学科，病理学与病理生理学、卫生毒理学、药理学等3个二级学科是广东省特色重点学科。临床检验诊断学等15个学科是市厅级重点学科。其中临床医学进入ESI学科排名的全球前1%，是广东省拥有ESI排名全球前1%学科7所高校之一。
