第一临床医学院是浙江中医药大学历史最悠久的学院，是国家级专业综合改革试点单位和国家级首批二类特色专业建设单位。学院目前承担培养中医学、临床医学和医学影像学三个专业学生，拥有教授、主任医师134人，副教授、副主任医师、副主任技师、副主任护师等236人，其中博导28人，硕士生导师110人，享受国务院特殊津贴专家2人，国家级名中医22人，省级名中医28人。现拥有博士后科研流动站2个，一级博士点2个，一级硕士点3个，学院被国家中医药管理局正式确定为国家中医临床研究基地（血液病重点研究基地），先后获得了国家科技进步奖二等奖、中华中医药学会科学技术奖一等奖、省科学技术进步一二三等奖等30项，获得其他省级科技成果奖共150项。
学院坚持“以学生为本” 的办学理念，遵循“求本远志”校训，立足培养具有正确的临床思维和较高的临床诊疗水平，具备较好的传承与科学研究能力，具有扎实的现代医学知识的拔尖创新临床人才和医学影像学人才。
办学50余载，学院已形成“秉承传统，融合现代，努力培养高素质临床人才”的专业办学特色，并以其办学特色鲜明、师资力量雄厚、课程设置合理、教学设施完备、人才培养符合社会需要、毕业生质量优秀等优势，近5年中医医师资格考试通过率位居全国中医院校第二。
康复医学院是在浙江中医药大学附属康复医院（浙江康复医疗中心）平台上建立的新兴学院。学院康复治疗学专业建于2003年，是全国中医院校第一批设立本专业的院校之一。目前开设康复治疗学专业，开展四年制康复治疗学人才培养。2011年，搭建康复治疗学专业实验培训平台，提高实验教学内容所占比例，突出康复治疗课程中实践技能的培养，培养学生的操作能力及科研创新能力。2016年康复治疗学专业立项为浙江省“十三五”优势特色专业。学院现有专任教师26人，其中教授7人、副教授8人、讲师及中级7人、助教和初级4人，副高级以上职称占57%。学院拥有康复医学与理疗学硕士学位授权点1个。
学院坚持“以学生为本” 的办学理念，遵循“求本远志”校训，立足培养具有良好的人文视野、科学和职业素养，具有熟练的康复治疗实践技能及较强创新思维能力的康复应用实践型人才。实行“院院合一”办学模式，根据“应用型”人才的需要，实行“校内实训--临床见习--医院实习”一体化的培养模式；高度重视教学基地建设，学院及附属医院建有康复评定实训室、运动治疗实训室、作业治疗实训室、语言治疗实训室，共计1000余平方米，拥有仪器设备500余件，总值约1000万元；后期教学主要临床教学基地浙江康复医疗中心建筑面积达4.3万平方米，康复床位数492张，设有浙江首家康复名医馆、浙江名中医馆（滨江）和浙江规模最大的儿童康复基地。
目前学院共有本科生300余人，研究生15人。我院学生在2016年参加 “全国康复治疗学与运动康复专业学生技能大赛”，获得团队二等奖；在其他国家级及省级学科竞赛如 “江中-远志杯”、“挑战杯”中多次获奖。
