重庆三峡医药高等专科学校是一所医学色彩浓郁的高校，有众多的专业，院系都有10来个，体系比较庞大，内容如下。
学校紧贴城乡基层和社会需求，打造优势专业品牌，开设有临床医学（中医）、护理、药学、医学技术、公共卫生、康复治疗、健康管理、药品制造和食品药品管理10大类29个专业，临床医学、预防医学、中医学、口腔医学、针灸推拿、中医骨伤6个国控专业设置齐全，形成了护理、中医骨伤、针灸推拿、中药等优势品牌专业，在全市乃至全国有较大影响。
学校是卫生部、国家中医药管理局确定的“护理领域技能型紧缺人才培养培训基地”、“乡镇卫生院中医临床骨干培训基地”、“乡镇卫生院院长培训基地”，是重庆市教委批准的“三峡中医药国际培训中心”，是重庆市人力资源和社会保障局确定的“国家职业技能鉴定所”。
学校实践教学体系完善，校内建有基础医学、护理、临床、中医、药学五个职业教育实训中心和中药科技馆、生命科学馆、三峡中医药文化陈列馆，有直属附属医院1所，非直属附属医院7所。
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